สำหรับการใช้เครื่อง ควรที่จะตั้งชั่วโมงการทำงาน สำหรับการบำรุงรักษาเครื่องด้วย เพื่อให้เครื่องอยู่ในสภาพพร้อมใช้งานเสมอ รวมไปถึงงานที่ปริ้นออกมา จะได้มีขนาดที่ตรงตามแบบที่เขียนไว้ เพราะถ้าไม่บำรุงรักษา ชิ้นส่วนของเครื่องบางชิ้น อาจทำงานติดขัด ทำให้งานปริ้นเสีย
การดูแลรักษาฐานพิมพ์งาน
ตัวเครื่อง Ender 3 V3 Se จะมาพร้อมกับแผ่นเหล็กฐานพิมพ์แบบแม่เหล็ก ซึ่งสามารถที่จะยกออก แล้วบิด เพื่อเอาชิ้นงานออกได้ ซึ่งตัวแผ่น จะมีการเคลือบสาร ที่ช่วยให้พลาสติกติดแน่น เวลาพิมพ์ สำหรับการใช้งานแผ่น ก็ไม่ควรที่จะบิดและงอแผ่น มากเกินไป เพราะจะทำให้แผ่นเสียรูป รวมไปถึงเวลาเอาชิ้นงานออก แนะนำให้ แผ่นฐานเย็นก่อน แล้วจึงค่อยบิดออก เวลาบิด ให้บิดขึ้นและลง ตามมุมของแผ่น

เส้นพลาสติกบางชนิด อาจจะพิมพ์แล้วไม่ติดกับฐาน จำเป็นจะต้องใช้ตัวช่วย จำพวกกาว ซึ่งแนะนำให้ใช้กาวน้ำ Magigoo ที่ทำขึ้นมาสำหรับการพิมพ์ 3 มิติ โดยเฉพาะ ตัวกาวมีหลายสูตรและสามารถใช้กับพลาสติกได้หลายชนิด ข้อดีของกาวน้ำ คือไม่ทิ้งคราบ ลงบนฐานพิมพ์ สามารถใช้ได้หลายครั้ง ในการทาครั้งเดียว รวมไปถึง ล้างน้ำเปล่า ทำความสะอาดได้เลย

การใส่จารบีหล่อลื่น
การดูแลรักษาในส่วนของ Lead Screw และแกนเหล็ก จะช่วยให้งานปริ้นออกมา เรียบและเนียน ดังนั้น แนะนำให้ใส่ทุกๆ อาทิตย์ ซึ่งจารบี ที่แนะนำ จะเป็นจารบีที่มีเนื้อสีขาว หรือมีส่วนผสมของ PTFE หรือเทฟลอน

สำหรับเครื่อง Ender 3 V3 SE จะมีตำแหน่งในการใส่จารบี ด้วยกัน 2 จุด คือ แกน Lead Screw และ แกนเครื่องฐานพิมพ์หรือแกน Y เวลาใส่จารบี แนะนำให้ปิดเครื่องก่อน แล้วค่อยใส่จารบี ถ้าเป็นแกน Z (ขึ้น-ลง) ให้ลากสายพานที่อยู่ด้านบน เพื่อให้แกนขยับ ส่วนที่เป็นฐานพิมพ์ ก็ใช้มือลากได้เลย เวลาขยับแกน แนะนำให้ทำช้าๆ เพราะถ้าลากเร็วเกิน จะเกิดกระแสไฟย้อน ไปที่บอร์ดของเครื่องได้

การเปลี่ยนหัวฉีด
หัวฉีดที่ถือเป็นชิ้นส่วนสำคัญ และเป็นปลายทางที่พลาสติก จะไหลออกมา งานสวยหรือไม่สวยก็ขึ้นอยู่กับหัวฉีด ซึ่งหัวฉีดก็เป็นชิ้นส่วนที่สึกหรอเหมือนกัน เวลาใช้ไปนานๆ รูของหัวฉีด อาจจะมีการขยายใหญ่ขึ้น เพราะเจอการเสียดสี ทำให้งานที่ปริ้นออกมา ไม่สวย หรือมีขนาดไม่ตรงตามแบบ
สำหรับการเปลี่ยนหัวฉีดเครื่อง Ender 3 V3 SE ก่อนอื่นให้ถอดตัวซิลิโคนหุ้มหัวฉีดออกก่อน ซึ่งสามารถดึงออกมาตรงๆได้เลย

เมื่อถอดเอาซิลิโคนออกแล้วก็จะเห็นหัวฉีด ให้ทำการ Preheat หัวฉีด ให้หัวฉีดร้อน เพื่อจะช่วยให้การเอาหัวฉีดออกง่าย เมื่อความร้อนได้แล้ว ให้เอาประแจขันเอาหัวฉีดออก เวลาขันอาจจะต้องใช้ประแจอีกตัว จับที่ตัว Heat Block ก่อน แล้วค่อยขันเอาหัวฉีดออก

เมื่อขันเอาหัวฉีดออกแล้ว ให้ปิดเครื่อง แล้วรอให้ความร้อนหายไป พอที่จะเอามือจับได้ ก็ให้เอาหัวฉีดอันใหม่ขันใส่เข้าไป เวลาขันก็ขันให้สุด แต่ยังไม่ต้องขันแน่น เมื่อใช้มือขันแล้ว ก็ให้เปิด Preheat เพื่ออุ่นหัวฉีดให้ร้อนอีกครั้ง เมื่อความร้อนได้ที่แล้ว ก็ให้เอาประแจขันหัวฉีดให้แน่น เวลาขันก็ให้เอาประแจอีกตัวจับไปที่ Heat Block แล้วค่อยขัน

พอขันหัวฉีดแน่นแล้ว ก็ให้ปิดเครื่อง รอหัวฉีดเย็นตัวลง เสร็จแล้วให้เอาซิลิโคนหุ้มหัวฉีด ใส่กลับเข้าที่เดิม
